毛細管電泳是以彈性石英毛細管為分離通道，以高壓直流電場為驅動力，依據樣品中各組分之間淌度和分配行為上的差異而實現分離的電泳分離分析方法。

　　毛細管電泳的使用方法介紹：

　　（1）按照儀器操作手冊開機，預熱、輸入各項參數，如毛細管溫度、操作電壓、檢測波長和沖洗程序等。操作緩沖液需過濾和脫氣。沖洗液、緩沖液等放置于樣品瓶中，依次放入進樣器。

　　（2）毛細管處理的好壞，對測定結果影響很大。未涂層新毛細管要用較濃堿液在較高溫度（例如用1mol/L氫氧化鈉溶液在60℃）沖洗，使毛細管內壁生成硅羥基，再依次用0.1mol/L氫氧化鈉溶液、水和操作緩沖液各沖洗數分鐘。兩次進樣中間可僅用緩沖液沖洗，但若發現分離性能改變，則開始須用0.1mol/L氫氧化鈉溶液沖洗，甚至要用濃氫氧化鈉溶液升溫沖洗。凝膠毛細管、涂層毛細管、填充毛細管的沖洗則應按照所附說明書操作。沖洗時將盛溶液的試樣瓶依次置于進樣器，設定順序和時間進行。

　　（3）操作緩沖液的種類、pH值和濃度，以及添加劑［用以增加溶質的溶解度和（或）控制溶質的解離度，手性拆分等］的選定對測定結果的影響也很大，應照各品種項下的規定配制，根據初試的結果調整、優化。

　　（4）將待測供試品溶液瓶置于進樣器中，設定操作參數，如進樣壓力（電動進樣電壓）、進樣時間、正極或負極進樣、操作電壓或電流、檢測器參數等，開始測試。根據初試的電泳譜圖調整儀器參數和操作緩沖液，以獲得優化結果。而后用優化條件正式測試。

　　（5）測試完畢后用水沖洗毛細管，注意將毛細管兩端浸入水中保存，如果長久不用應將毛細管用氮吹干，最后關機。

　　（6）定量測定以采用內標法為宜。用加壓或減壓法進樣時，供試品溶液黏度會影響進樣體積，應注意保持試樣溶液和對照溶液黏度一致；用電動法進樣時，被測組分因電歧視現象和溶液離子強度會影響待測組分的遷移量，也要注意其影響。